針對中央氣象局召開記者會，公布各縣市總雨量，台南市長賴清德30日與江院長前往仁德勘災時特別說明，各縣市是以「24小時雨量預測」判斷是否停班停課，而非總雨量預估，中央氣象局以總雨量資料，說各縣市早已達停班停課標準，這是混淆視聽，對站在第一線努力工作的地方政府非常不公平。



賴市長說，台南市28日晚上10時依據中央氣象局24小時雨量預測，平地雨量150mm~300mm，山地（楠西、南化）雨量250mm~450mm，他當下曾去電關切上述2區，了解雨勢不大，狀況良好。29日上午5時在做決策前，氣象局提供資料為平地雨量150mm~300mm，山地雨量200mm~400mm（雨量有下修），但為以防萬一，賴市長在宣布正常上班上課之前，亦去電關切新化、關廟、仁德、歸仁等區確認雨勢不大，才發布正常上班上課。



中央氣象局直到29日上午10時，才將「24小時雨量預測」上修為平地200mm~400mm，山地200mm~400mm，達到停班停課的標準，市府即在11時宣布當天下午停班停課。賴市長進一步指出，他觀看雷達回波雲圖亦顯示雲雨帶往北方嘉義、雲林方向移動，即將離開台南市，這一點市府也求證中央氣象局，並得到確認；另市府監測的雨情，只有29日上午3~4時的雨量較多，最高10分鐘降雨量20mm，但5點的時候已減少到2mm，市府並比較其他縣市情況後才做下決策。



賴市長指出，他能體諒中央氣象局的辛苦，以及氣象預報科技本身的不足，但現在各大報都引用中央氣象局昨日召開記者會的總雨量來指責地方政府應該提早宣布停班停課，這是不對的。賴市長認為將整個決策過程說明清楚，可供社會檢驗，他希望大家能以正確的數據來討論。



賴市長於29日上午5點於災害應變中心針對停班停課決策進行討論，6點多離開災害應變中心，約於7點45分至仁德區公所，後續進行仁德、大內、新化等地區一連串勘災行程。到上午10點接獲中央氣象局資料後趕回應變中心，並在11點宣布南市下午停班停課。