截至10月16日為止，臺南市入夏後登革熱本土病例數已累積達489例（東區7例、南區54例、中西區64例、北區82例、安南區254例、安平區4例、永康區16例、善化區2例，新營、新市、仁德、佳里、七股區、西港區各1例），新增之西港區病例其感染源仍於安南區，臺南市政府提醒市民，因登革熱疫情尚未緩解，仍需加強孳生源清除。
　　
10月16日市政府召集各局處，由陳美伶秘書長主持登革熱流行疫情指揮中心會議，呼籲市民唯有澈底清除積水容器，才能有效防治登革熱，並做以下裁示：
1.10月15及16日的病例數新增17例，顯見疫情未緩解，經疾病管制局推估，
可能因民眾發病到就醫時間過長，增加疫情擴散機率，為避免因此造成防疫
漏洞，請病例集中區域，針對空戶及不在戶加強進行孳生源檢查。
2.各區公所發現空屋有必要入內檢查者，可依傳染病防治法會同警察局及鎖匠
強制開鎖入內檢查，一切以防疫為優先。
3.由新聞及國際關係處安排局處首長或專家學者錄製登革熱宣導短片，藉由公
共頻道發布最新疫情及訊息，強化民眾警覺性及主動性。
4.軍方已針對廢棄眷村積極進行環境整頓工作，現階段仍以清除孳生源為主，
待疫情解除後，再規劃地區美化相關事宜。

市府再度呼籲市民，清除積水容器是防止登革熱發生及蔓延最根本的方法，請擁有閒置空屋空地的民眾，儘速主動巡視清除積水容器，一旦強制開鎖發現孳生源者，將依法進行裁處。