針對登革熱的防治，今年不僅僅是臺南的關鍵年，也是臺灣的關鍵年，市長賴清德在（3）日2016「臺南領航 全面防疫」第二季跨局處會議工作會報指出，今年防治成功，臺灣的登革熱不會變本土性，也可以阻止登革熱北上，責任重大，指示目前被列管的176里，包括區公所在內，特別加強列管輔導，一旦發現陽性孑孓，直接開單舉發。

賴市長表示，今年對於臺南登革熱防治來說，不僅僅是在維護我們市民的健康，對臺灣整個登革熱的防治工作也是深具意義。賴市長希望各界發揮去年團結，且分工合作的精神，特別是要針對全市309個里裡面，被列管的176里，特別列案輔導，發現陽性孑孓，直接開舉發單。

賴市長進一步指出，孳清與化學防治的工作，仍是今年防治的手段，請環保局或衛生局要特別注意藥的有效性，必要的話，請國家衛生研究院或是專家協助，確保其效益。

另外，即早治療不失防治效益。賴市長特別指出，倘若是年輕人、沒有慢性病者，可以先至診所就醫，如果是年紀大、有慢性病者，尤其是有糖尿病、腎臟病、或心血管疾病的人，就需直接到大醫院，避免延誤就醫。